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木聚糖酶可以應用在釀造、飼料工業中。木聚糖酶可以分解釀造或飼料工業中的原料細胞壁以及β-葡聚糖，降低釀造中物料的粘度，促進有效物質的釋放，以及降低飼料用糧中的非淀粉多糖，促進營養物質的吸收利用，并因而更易取可溶性脂類成分。木聚糖酶(xylanase)是指可將木聚糖降解成低
聚糖和木糖的一組酶的總稱，主要包括外切β -1,4- 木聚糖酶 內切β -1,4- 木聚糖酶和 - 木聚糖酶它可以將飼料的非淀粉多糖（NSPS）分解成較小聚合度的低聚木糖，從而改善飼料性能 ，或降低非淀粉多糖在動物腸胃中因粘度較大而引起的抗營養作用同時它可以破壞植物細胞壁的結構，提高內源性消化酶的活性，提高飼料養分的利用 另外，木聚糖酶在造紙 食品和紡織等行業中的應用也較為廣泛。木聚糖酶應用pH范圍3.5～6.0,適宜溫度范圍40℃～60℃，并能耐受高溫制粒的溫度幾分鐘。

可在糖化過程蛋白質休止期或后發酵中添加。通常為25~75 g/噸麥汁或發酵液汁。用量應通過實驗決定。

木聚糖是木纖維和非木纖維的主要組成成分。在紙漿蒸煮過程中，木聚糖部分溶解、變性并重新沉積在纖維表面上。此過程中若使用木聚糖酶，就可以部分再沉積下來的木聚糖。這樣增大了紙漿基質孔隙，使被困的可溶性木質素釋放出來，同時也使得化學漂白劑能更有效地滲透進入到紙漿中。總的說來，它可提高紙漿的漂白率，并因此減少化學漂白劑的用量。濰坊宇瑞貿易有限公司經營的木聚糖酶是降解木聚糖的專一性酶，它只降解木聚糖而不能使纖維素分解。木聚糖酶由不同微生物共同作用而形成，在一定pH和溫度范圍內使用可獲得效果。AU-PE89利用造紙工業專用菌種開發得到，它特別適用于牛皮紙漿的高溫和堿性pH環境。